在正篇中讲述五个童年玩伴曾经在小的时候组成了一个的小组织“Little Busters”，长大后升入高中的他们为了享受最后的高中生活，组建了一支棒球队名字依然像小时候一样叫作“Little Busters”，之后棒球队的成员们遇到了各种各样烦恼的故事。本作作为特典动画，剧情分别由二木佳奈多、笹濑川佐佐美、朱鹭户沙耶这三名在正篇剧情中属于配角的女性角色，主要围绕她们各自的故事展开。

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