持续旅行的小智皮卡丘一行，来到了流传着波导传说的城镇：欧鲁德朗城。城市的中心正举行着亚郎的祭典，小智与皮卡丘决定参加今年勇者对战。激烈的战斗之后，获得了冠军的小智当选为波导的勇者。城中举办了庆祝优胜者的盛大宴会，突然幻之神奇宝贝梦幻出现，带着皮卡丘消失了。与此同时，迷之神奇宝贝路卡利欧数百年前的封印被解开，在小智面前显现了身影的皮卡丘在哪？梦幻的目的是什么？还有，隐藏在路卡利欧身上的过去和波导传说的秘密是什么？带着所有谜团，小智与路卡利欧一起朝向世界初始之树开始了冒险。

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